Приказ об оказании всемерной помощи участникам переписи
Девять союзных и республиканских наркоматов, главные управления воздушного флота, Северного морского пути, другие ведомства издали приказы об оказании всемерной помощи участникам переписи. В труднодоступных районах перепись началась 1 октября 1938 г. в Горно-Бадахшанской автономной области Таджикской ССР, а закончилась в Карагандинской области Казахской ССР 10 февраля 1939 г. В степях Туркменистана и Казахстана ее провели экспедиционным способом. При переписи кочевого населения применялись нестандартные способы: на перекрестках широких, наиболее оживленных дорог устанавливали дежурства счетчиков, которые заполняли контрольные листки на проезжающих. Всего, по предварительным подсчетам, в труднодоступных районах было переписано свыше 1,5 млн человек. В районах Крайнего Севера перепись проводилась с 15 июня до 30 декабря 1939 г. , то есть более 6 месяцев. Задержка с ее проведением привела к искажению действительной численности населения в ряде районов, например в Нарьян-Маре, где перепись проводилась в разгар навигации на Печоре, и удорожанию затрат, связанных с ее производством. Общие итоги ее на 17,6 тыс. человек превысили расчетную цифру населения. Перепись военнослужащих проводили два наркомата — обороны и военно-морского флота. На флоте было переписано 195 433 военнослужащих, в том числе 51 женщина. В центральном управлении Наркомата обороны, 14 военных округах и других воинских формированиях Советского Союза по переписи 1939 г. оказалось 1 903 910 военнослужащих, в том числе 1014 женщин, 203 816 военных строителей, железнодорожников и водителей. Численность Вооруженных сил СССР, согласно переписи 1939 г., превысила 2 млн человек, в то время как официально считалось, что она составляет 1,3 млн.